מלגת נפש יהודי מעניקה מלגות בשווי 5,000 ש"ח עבור 138 שעות פעילות שנתיות. בסניפים מסויימים ובשת"פ מפעל הפיס ניתן לצבור עד 10,000 ₪ לשנה.
הפעילות הינה במפגשים קבועים פעם בשבוע של העשרה והעצמה בתחומים שונים כגון: יהדות, פילוסופיה, פסיכולוגיה ועוד. חשוב לציין שהפעילות בפריסה ארצית ב-20 סניפים שונים!
במסגרת הפעילות מתקיימות גם סדנאות ופעילויות מיוחדות, סיורים , מסעות לחו"ל והשתתפות בתוכניות ובכנסים בחו"ל למנהיגות צעירה בין לאומית.
המלגה מיועדת לסטודנטים בוגרי מערכת החינוך הממלכתית ותינתן עדיפות לבוגרי שירות צבאי.